Департамент по обеспечению эффективности программ и поддержке стран играет ведущую роль в поддержке разработки эффективных программ в ответ на СПИД, в том числе в гуманитарной сфере и в сфере безопасности, в целях обеспечения всеобщего доступа и достижения Целей в области развития, сформулированных в Декларации тысячелетия. Он проводит аналитические исследования и оказывает методическую и техническую поддержку странам в разработке и реализации национальных планов борьбы со СПИДом на основе научно подтвержденных данных, а также укрепляет потенциал отдельных стран в целях эффективной координации, управления и анализа ответных мер.
Департамент ведет работу по достижению большей слаженности, повышению эффективности и актуальности мероприятий системы ООН в поддержку национальных ответных действий и осуществляет руководство в области разработки программ и эффективности помощи. Он содействует оказанию технической поддержки и развитию потенциала и расширяет партнерские отношения со всеми заинтересованными сторонами, в частности, с Глобальным фондом и Чрезвычайным планом Президента США для оказания помощи в связи со СПИДом (ПЕПФАР), чтобы обеспечить эффективное и комплексное использование финансовых ресурсов.
В состав Департамента входят Отдел стратегической поддержки стран и Отдел по повышению эффективности помощи и потенциала стран. Директором Департамента является г-н Тим Мартино (Tim Martineau).